中国海洋大学学报自然科学版  2020, Vol. 50 Issue (1): 57-64  DOI: 10.16441/j.cnki.hdxb.20180388

引用本文  

林建城, 周文虎, 林娟娟. 中国鲎N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶活性必需基团的研究[J]. 中国海洋大学学报(自然科学版), 2020, 50(1): 57-64.
LIN Jian-Cheng, ZHOU Wen-Hu, LIN Juan-Juan. Study on the Essential Groups of the β-N-acetyl-D-glucosaminidase from the Viscera of Horseshoe Crab(Tachypleus tridentatus)[J]. Periodical of Ocean University of China, 2020, 50(1): 57-64.

基金项目

福建省自然科学基金计划项目(2018J01467);福建省新型污染物生态毒理效应与控制重点实验室开放课题项目(PY16009)资助
Supported by the Natural Science Foundation of Fujian Province of China(2018J01467); the Open Project from Fujian Provincial Key Laboratory of Ecology-Toxicological Effects & Control for Emerging Contaminants(PY16009)

作者简介

林建城(1966-),男,教授,从事海洋生物酶学的研究工作。E-mail:ptljc660402@sina.com

文章历史

收稿日期:2018-11-25
修订日期:2019-04-10
中国鲎N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶活性必需基团的研究
林建城 , 周文虎 , 林娟娟     
莆田学院环境与生物工程学院,福建省新型污染物生态毒理效应与控制重点实验室,福建 莆田 351100
摘要:为了探讨中国鲎N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶(EC3.2.1.52,NAGase)活性的必需基团,采用了化学修饰法进行研究,分别以甲醛、乙酸酐、三硝基苯磺酸、对氯汞苯甲酸、苯甲基磺酰氟、二巯基苏糖醇、乙酰丙酮、溴代乙酸、碘代乙酸、N-溴代琥珀酰亚胺等10种修饰剂,在特定环境中对中国鲎NAGase进行化学修饰。结果表明:中国鲎NAGase中赖氨酸的ε-氨基、组氨酸的咪唑基、色氨酸的吲哚基和丝氨酸的羟基经修饰后,酶活力几近丧失,这些氨基酸基团为酶活性的必需基团,且可能处于酶的活性部位;半胱氨酸的巯基经修饰后不完全失活,说明半胱氨酸的巯基是NAGase催化活性所必需的,但可能不处于酶的活性部位;酶的二硫键被修饰后,酶活力明显下降,说明二硫键在维系NAGase的三维空间构象中起重要作用;而精氨酸的胍基经修饰后酶的活性基本不变,因此,精氨酸不是NAGase的必需基团。
关键词中国鲎    N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶(NAGase)    化学修饰    必需基团    

几丁质酶可降解几丁质中N-乙酰葡萄糖胺C1和C4间的糖苷键,是属于糖基水解酶类。Broadway等[1]根据几丁质酶作用机理不同,认为其至少包含有内切几丁质酶、外切几丁质酶和N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶(EC3.2.1.52,NAGase)等3种不同组分,其中NAGase主要是通过对几丁质外切生成β-N-乙酰葡萄糖胺单体和寡聚糖,并将外切几丁质酶酶解几丁质产生的几丁二糖继续降解为单体。几丁质酶在动植物、微生物体内普遍存在,在不同生物体中也发挥着不同的生理作用[2];其中节肢动物几丁质酶除了起到对含几丁质的食物进行酶解消化外,还与节肢动物周期性蜕皮蜕壳的生理现象密切相关[3]。为了阐明几丁质酶在昆虫、虾蟹、鲎等这些节肢动物周期性蜕皮过程的生理作用,几丁质酶的组成结构及其催化机理成为了研究热点[4]

目前,对几丁质酶功能基团的研究方法主要有蛋白质化学修饰法和定点突变技术。Fan等[5]用酶的定点突变技术研究了舞毒蛾(Lymantria dispar)几丁质酶的功能基团,发现Asp143、Asp145和Trp146三个具有高度保守性的氨基酸残基与酶催化活性密切相关;Lu等[6]也用该技术研究表明:烟草天蛾(Manduca sexta)几丁质酶Trp142、Asp144和Glu146是酶活性部位的必需基团,Glu146在几丁质降解中主要起酸碱催化作用。Jin等[7]则采用蛋白质化学修饰法研究了锯缘青蟹(Scylla serrata)NAGase的功能基团,证明了色氨酸是酶活性的必需基团,而酶中二硫键和精氨酸的胍基不是酶活性所必需的;Xie等[8]也对凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)NAGase进行化学修饰,结果证明色氨酸是对虾NAGase的必需基团,酶反应动力学研究还发现对虾NAGase酶分子催化活性只需一个色氨酸残基参与。课题组已从中国鲎(Tachypleus tridentatus)分离纯化到NAGase[9],在研究其酶学性质的基础上,本研究进一步通过化学修饰法探讨了中国鲎NAGase的功能基团,为揭示中国鲎在生活周期中蜕皮与几丁质酶活性之间的相关性奠定理论基础。

1 材料与方法 1.1 材料

参照文献[9]所述方法分离纯化中国鲎NAGase,分别通过抽提、30%和80%的饱和硫酸铵分级分离、Sephadex G-200凝胶层析以及DEAE-32离子交换层析分离,纯化后获得聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)单一纯的酶制剂,比活力为505.21 U/mg,酶制剂在4 ℃下经过双蒸馏水透析后,用于酶化学修饰的研究。

NAGase催化的底物对硝基苯-N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷(pNP-β-D-GlcNAc),由上海医药工业研究院生化室合成;Sephadex G-200出自Pharmacia;纤维素DEAE-32是Whatman产品;对氯汞苯甲酸(p-chloromercuribenzoate,pCMB)是Sigma产品;苯甲基磺酰氟(Phenylmethanesulfonyl fluoride,PMSF)为Merk公司产品;甲醛、乙酸酐、三硝基苯磺酸(Trinitrobenzene sulfonic acid,TNBS)、二巯基苏糖醇(Dithiothreitol,DTT)、乙酰丙酮(Acetylacetone,AA)、溴代乙酸(Bromoacetic acid,BrAc)、碘代乙酸(Iodoacetic acid,IAc)、N-溴代琥珀酰亚胺(N-bromosuccinimide,NBS),以及其它试剂均为国产分析纯。

1.2 方法 1.2.1 中国鲎内脏NAGase活力测定

中国鲎内脏NAGase活力的测定方法参考文献[9]。在2 mL的酶测活体系中,包含1 mL 75 mmol/L HAC-NaAC缓冲液(pH=5.4),0.2 mL 5 mmol/L的底物pNP-β-D-GlcNAc,0.78 mL的双蒸馏水,20 μL酶液。在37 ℃下反应10 min,以2 mL 0.5 mol/L NaOH终止反应,测定A405 nm,以未加入酶制剂的为空白对照组。

1.2.2 中国鲎内脏NAGase功能基团的化学修饰

选择TNBS等10种化学修饰剂,分别在不同修饰体系中对中国鲎NAGase进行化学修饰。TNBS、乙酸酐和DTT等3种修饰剂对酶的修饰在0.01 mol/L Tris-HCl(pH=8.0)缓冲体系37 ℃下进行,PMSF对酶的修饰采用同样的缓冲体系,但是在25 ℃下进行;甲醛和NBS均在37 ℃下0.20 mol/L NaAc-HAc(pH=5.4)的缓冲体系中对酶进行修饰;乙酰丙酮则是在37 ℃下,0.01 mol/L Tris-HCl(pH=9.0)的缓冲体系中对酶进行修饰;在0.10 mol/L NaAc-HAc(pH=6.0)缓冲体系中,溴代乙酸在25 ℃下,碘代乙酸在37 ℃下分别对酶进行修饰;而pCMB是在0.05 mol/L NaAc-HAc(pH=5.8)缓冲体系中,37 ℃下对酶进行修饰。

修饰酶活力的测定:在NAGase酶液中按一定比例(V: V修饰剂=1:3)分别加入不同的修饰剂,于各自的修饰体系中修饰30 min,然后取出50 μL的修饰酶,在NAGase测活体系中测定酶的剩余活力,设立了对照组,在化学修饰试验中,为了排除修饰剂本身对试验的干扰,在对照组设置中,则是在加入2 mL 0.5 mol/L NaOH后再加入50 μL修饰酶制剂。以测得的未修饰酶活力为100%,而修饰酶活力以相对酶活力(%)表示。

1.2.3 NBS对NAGase紫外吸收光谱和内源荧光发射光谱的影响

NAGase经0、2、3、5、10 μmol/L浓度NBS化学修饰后,分别用日本岛津UV-2550型紫外分光光度计扫描,测定NAGase经修饰后的紫外吸收峰。此外,NAGase经0、2、5、10、15、20 μmol/L浓度NBS化学修饰后,分别用美国Cary Eclipse荧光分光光度计扫描,在酶内源荧光激发光谱波长为230.9 nm下,测定NAGase经修饰后的内源荧光发射光谱峰。

2 结果与分析 2.1 中国鲎内脏NAGase的分离纯化

中国鲎内脏NAGase通过抽提、硫酸铵沉淀分级分离、凝胶层析以及离子交换层析后,获得NAGase酶制剂,透析后经PAGE和SDS-PAGE检定,电泳图谱均显示一谱带(见图 1),说明经分离纯化后NAGase已达到电泳纯,用此纯酶制剂进行酶的化学修饰试验。

图 1 中国鲎NAGase的PAGE(a)及SDS-PAGE(b)图谱 Fig. 1 PAGE(lane a) and SDS-PAGE (lane b) of the purified NAGase from Tachypleus tridentatus
2.2 氨基的化学修饰

采用甲醛和乙酸酐两种氨基修饰剂[10],分别对中国鲎NAGase进行化学修饰,发现NAGase经8 mmol/L甲醛修饰后,酶活力仅剩4.1%(见图 2);而乙酸酐在0~200 mmol/L浓度范围内,对NAGase化学修饰的结果表明:随乙酸酐修饰剂浓度的增加,NAGase活力逐渐下降,呈浓度效应,当乙酸酐修饰剂浓度达到200 mmol/L时,NAGase活力丧失了97.8%(见图 3)。有许多化合物可以修饰酶蛋白中赖氨酸ε-氨基,TNBS也是其中非常有效的一种[11]。研究发现,随着化学修饰剂TNBS浓度的增大,NAGase活力逐渐下降,20 mmol/L TNBS可使中国鲎NAGase活力丧失94.7%(见图 4)。这些结果表明了:NAGase的赖氨酸ε-氨基被化学修饰后,酶的活性变化大,赖氨酸ε-氨基是中国鲎NAGase活性的必需基团。

图 2 甲醛对中国鲎NAGase的修饰作用 Fig. 2 Modification of NAGase from T. tridentatus by formaldehyde

图 3 乙酸酐对中国鲎NAGase的修饰作用 Fig. 3 Modification of NAGase from T. tridentatus by Acetic anhydride

图 4 TNBS对中国鲎NAGase的修饰作用 Fig. 4 Modification of NAGase from T. tridentatus by TNBS
2.3 羟基的化学修饰

PMSF是蛋白质中丝氨酸羟基的专一化学修饰剂[11]。在偏碱性条件下,采用PMSF对中国鲎NAGase酶蛋白中丝氨酸羟基进行专一的化学修饰。结果见图 5,随着修饰剂PMSF浓度的升高,修饰后酶的活力逐渐降低,当修饰剂PMSF浓度达到200 mmol/L时,NAGase活力几乎丧失,结果表明:中国鲎NAGase酶蛋白中丝氨酸的羟基对酶活力是必需的,是酶的必需基团。

图 5 PMSF对中国鲎NAGase的修饰作用 Fig. 5 Modification of NAGase from T. tridentatus by PMSF
2.4 巯基的化学修饰

巯基基团是蛋白质分子中极易发生反应的侧链基团,其中有机汞试剂是最早使用的巯基修饰试剂,其中pCMB能专一修饰酶蛋白中半胱氨酸巯基[12]。选用有机汞试剂pCMB对中国鲎NAGase进行化学修饰,结果(见图 6)表明,NAGase经pCMB化学修饰后,酶活力发生较大变化,当修饰剂pCMB浓度达到0.5 mmol/L时,NAGase活力已丧失83.4%,NAGase活力下降应该是由于半胱氨酸巯基被修饰后酶蛋白的空间构象发生变化所致,说明半胱氨酸巯基是中国鲎NAGase活性的必需基团。

图 6 pCMB对中国鲎NAGase的修饰作用 Fig. 6 Modification of NAGase from T. tridentatus by pCMB
2.5 二硫键的化学修饰

在偏碱性条件下,常用DTT将蛋白质中的二硫键还原成游离巯基,对其进行特异性的化学修饰[12]。DTT对中国鲎NAGase酶蛋白的化学修饰结果如图 7所示,可见随着修饰剂DTT浓度的提高,NAGase活力呈不断下降趋势,当DTT浓度达120 mmol/L时,酶活力则丧失了81.3%。DTT还原了NAGase酶蛋白中的二硫键,而二硫键的还原导致酶蛋白的空间构象发生改变,从而使酶催化活力发生改变。说明中国鲎NAGase酶蛋白中的二硫键与酶活力密切相关,其二硫键在维系酶蛋白的三维空间构象中起重要作用。

图 7 DTT对中国鲎NAGase的修饰作用 Fig. 7 Modification of NAGase from T. tridentatus by DTT
2.6 胍基的化学修饰

精氨酸残基含有一个呈碱性的胍基,酶活性部位的胍基能结合带有阴离子的底物,乙酰丙酮则能专一地修饰酶蛋白精氨酸残基中胍基[13],在偏碱性条件下,乙酰丙酮与胍基相互作用后改变了精氨酸侧链基团的结构,从而影响酶蛋白的性质,导致与底物的亲和力发生变化。在本试验中,发现乙酰丙酮在0~140 mmol/L浓度范围内,中国鲎NAGase经乙酰丙酮修饰后酶活力基本没有变化,说明精氨酸胍基与NAGase活性无关,精氨酸胍基不是中国鲎NAGase活性的必需基团。

2.7 咪唑基的化学修饰

组氨酸咪唑基是许多酶活性部位的组成部分,在偏酸性的条件下,BrAc对酶蛋白中组氨酸残基进行取代反应,生成羧甲基衍生物,可以特异性修饰蛋白质中的组氨酸咪唑基[11]。BrAc对中国鲎NAGase的化学修饰结果(见图 8)表明,当BrAc浓度达到150 mmol/L时,NAGase活力只剩5.4%,几乎丧失酶活力。进一步采用IAc作为中国鲎NAGase组氨酸咪唑基的化学修饰剂[10],结果如图 9所示,120 mmol/L IAc可使酶活力丧失93.5%。说明组氨酸咪唑基与中国鲎NAGase活力密切相关,组氨酸咪唑基是中国鲎NAGase活性所必需的。

图 8 BrAc对中国鲎NAGase活力的影响 Fig. 8 Modification of NAGase from T. tridentatus by BrAc

图 9 IAc对中国鲎NAGase活力的影响 Fig. 9 Modification of NAGase from T. tridentatus by IAc
2.8 吲哚基的化学修饰

NBS是蛋白质中色氨酸的特异性修饰试剂,可使吲哚基团氧化成羟吲哚衍生物,导致蛋白质性质发生变化[7]。NBS化学修饰中国鲎NAGase的结果(见图 10)表明:经低浓度的NBS修饰后NAGase活力则迅速下降,25 μmol/L NBS修饰酶后,NAGase活力几近丧失,说明中国鲎NAGase色氨酸吲哚基被氧化后酶催化活力发生较大变化。

图 10 NBS对中国鲎NAGase的修饰作用 Fig. 10 Modification of NAGase from T. tridentatus by NBS

此外,中国鲎NAGase经NBS修饰后,酶蛋白的紫外吸收光谱和荧光发射光谱强度也发生相应变化。在0~5 μmol/L浓度范围内,随着修饰剂NBS浓度的增大,NAGase酶蛋白在273 nm波长处的紫外吸收峰值逐渐降低,10 μmol/L NBS下紫外吸收峰消失(见图 11)。而NAGase酶蛋白内源荧光发射光谱峰在330.9 nm波长处,但NBS修饰后NAGase酶蛋白的荧光强度发生变化(见图 12),随修饰剂NBS浓度增大,酶蛋白荧光强度呈不断下降趋势,荧光发射光谱峰出现向短波长移动(“蓝移”)现象,20 μmol/L NBS使NAGase酶蛋白的荧光发射几近焠灭,说明NBS对NAGase的生色基团——色氨酸的苯环修饰后,酶蛋白的空间构象发生较大变化,导致酶活力丧失;由于苯环共轭体系破坏,加上Trp残基经NBS修饰后其疏水性可能有所增强,导致荧光发射光谱峰发生“蓝移”现象,随着NBS浓度增大,“蓝移”越多[14-15]。上述结果表明:色氨酸是中国鲎NAGase活性的必需基团。

(曲线1~5:NBS浓度分别为0、2、3、5、10 μmol·L-1。The final concentrations of NBS were 0, 2, 3, 5 and 10 μmol·L-1 for curves 1~5, respectively.) 图 11 中国鲎NAGase在NBS中的紫外吸收光谱 Fig. 11 UV absorption spectra of NAGase from T. tridentatus modified by NBS

(曲线1~6, NBS浓度分别为0、2、5、10、15、20 μmol·L-1。The final concentrations of NBS were 0, 2, 5, 10, 15 and 20 μmol·L-1 for curves 1~6, respectively.) 图 12 中国鲎NAGase在NBS中的内源荧光发射光谱 Fig. 12 Fluorescence emission spectra of NAGase from T. tridentatus modified by NBS
3 讨论

蛋白质化学修饰法已广泛应用在酶蛋白活性基团的研究中。石艳等[12]采用化学修饰法研究了菜青虫(Pieris brassicae)表皮NAGase活性的必需基团,结果表明:半胱氨酸(Cys)的巯基、色氨酸(Trp)的吲哚基、组氨酸(His)的咪唑基是NAGase的必需基团;精氨酸(Arg)残基及赖氨酸(Lys)的ε-氨基不是菜青虫NAGase的必需基团。Jin等[7]也研究了锯缘青蟹(Scylla serrata)内脏NAGase的必需基团,结果显示Trp的吲哚基、His的咪唑基、Lys的ε-氨基是NAGase活性所必需的,Arg胍基和二硫键则不是锯缘青蟹NAGase的必需基团。Xie等[8]对凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)NAGase的必需基团研究表明:Trp的吲哚基、His的咪唑基、Lys的ε-氨基是NAGase活性所必需的,而Arg胍基和二硫键不是凡纳滨对虾NAGase活性所必需的。此外,林心宇等[16]研究了槐猪精液中NAGase的功能基团,研究判断Cys的巯基、Trp的吲哚基、His的咪唑基以及Lys的ε-氨基是NAGase活性中心的功能基团,二硫键也是槐猪精液NAGase活性所必需的,但Arg的胍基不是酶活性所必需的基团。前已研究的蝾螺(Turbo cornutus Solander)[11]内脏NAGase的必需基团,发现Cys巯基和丝氨酸(Ser)羟基不是酶活性的必需基团,而Trp的吲哚基、Lys的ε-氨基是蝾螺NAGase活性部位的必需基团,而His的咪唑基是酶催化活性所必需的,但可能不处于酶的活性部位。

本研究结果表明:中国鲎NAGase中Lys ε-氨基、His咪唑基、Trp吲哚基和Ser羟基经化学修饰后,酶活力几近丧失,这些氨基酸基团判断为中国鲎NAGase活性的必需基团,且可能处于酶的活性部位;Cys巯基经修饰后酶活力下降,但不完全失活,说明Cys巯基是中国鲎NAGase催化活性所必需的,但可能不处于酶的活性部位;DTT修饰NAGase中的二硫键后,酶活力明显下降,证明二硫键在维系中国鲎NAGase酶蛋白三维空间构象中起重要作用;而Arg胍基经修饰后NAGase活性基本不变,说明Arg胍基不是中国鲎NAGase的必需基团。

总之,从不同生物来源NAGase酶蛋白的必需基团分析,Trp的吲哚基、His的咪唑基是大多数生物NAGase活性的必需基团,Arg胍基、Lys的ε-氨基、Cys巯基和二硫键在不同生物来源的NAGase中发挥着不同作用。

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Study on the Essential Groups of the β-N-acetyl-D-glucosaminidase from the Viscera of Horseshoe Crab(Tachypleus tridentatus)
LIN Jian-Cheng , ZHOU Wen-Hu , LIN Juan-Juan     
College of Environmental and Biological Engineering, Fujian Provincial Key Laboratory of Ecology-toxicological Effects & Control for Emerging Contaminants, Putian University, Putian 351100, China
Abstract: In order to identify the essential groups of β-N-acetyl-D-glucosaminidase(EC3.2.1.52) from the viscera of horseshoe crab(Tachypleus tridentatus), the chemical modification method had been used. The enzyme was modified respectively by ten chemical modification reagents, such as formaldehyde, acetic anhydride, trinitrobenzene sulfonic acid(TNBS), phenylmethanesulfonyl fluoride(PMSF), p-chloromercuribenzoate(pCMB), dithiothreitol(DTT), acetylaceton(AA), bromoacetic acid(BrAc), iodoacetic acid(IAc), N-bromosuccinimide(NBS) at certain condition. The results showed that the enzyme activity was almost lost when lysine's ε-amido group, histidine's imidazolyl group, tryptophan's indolyl group and serine's hydroxyl group were modified respectively, which means that these groups were essential for the enzyme catalytic activity, and probably situated in the active site of enzyme. The modification of cysteine's sulfhydryl group led to inactivate incompletely, indicating sulfhydryl group was essential for the enzyme catalytic activity, but it might not be the composing groups of the enzyme active center. The enzyme activity was decreased significantly when the disulfide bond of enzyme were modified, which means that disulfide bond were essential for maintaining the enzyme's conformation. The results also showed that the arginine's guanidyl group was irrespective with the enzyme activity.
Key words: Tachypleus tridentatus    β-N-acetyl-D-glucosaminidase    chemistry modification    essential groups