高校化学工程学报    2024, Vol. 38 Issue (2): 243-252  DOI: 10.3969/j.issn.1003-9015.2024.02.009
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引用本文 

谭远志, 张鹏程, 孙艳娜, 张其磊, 姚善泾, 林东强. Oligo(dT)亲和层析介质的载量比较和机制分析[J]. 高校化学工程学报, 2024, 38(2): 243-252.   DOI: 10.3969/j.issn.1003-9015.2024.02.009.
TAN Yuanzhi, ZHANG Pengcheng, SUN Yanna, ZHANG Qilei, YAO Shanjing, LIN Dongqiang. Binding capacity and mechanism analysis of four Oligo(dT) affinity chromatography resins[J]. Journal of Chemical Engineering of Chinese Universities, 2024, 38(2): 243-252.   DOI: 10.3969/j.issn.1003-9015.2024.02.009.

基金项目

国家重点研发计划(2021YFC2103401, 2021YFE0113300);国家自然科学基金(22078286)。

通讯联系人

林东强,E-mail:lindq@zju.edu.cn

作者简介

谭远志(2000-),男,湖南衡阳人,浙江大学硕士生。

文章历史

收稿日期:2023-03-28;
修订日期:2023-05-15。
Oligo(dT)亲和层析介质的载量比较和机制分析
谭远志 , 张鹏程 , 孙艳娜 , 张其磊 , 姚善泾 , 林东强     
浙江大学生物质化工教育部重点实验室, 浙江大学 化学工程与生物工程学院, 浙江 杭州 310058
摘要:针对Oligo(dT) 亲和层析介质的吸附性能,以poly(A)为模型分子,考察了4种Oligo(dT)亲和层析介质的静态吸附平衡、吸附动力学和动态结合载量(DBC),探讨了载量影响相关机制。结果表明,4种介质的合适吸附条件均为0.6 mol⋅L−1 NaCl、pH= 6~7;Monomix dT20静态吸附容量最大,且poly(A)能扩散至介质微球深层孔内,而Poros Oligo (dT)25、Praesto Jetted (dT)25和NanoGel dT20等3种介质中poly(A)均主要为表层吸附、静态吸附容量稍低;对于DBC,NanoGel dT20和Monomix dT20的10% 穿透的DBC较高,而Poros Oligo (dT)25和Praesto Jetted (dT)25相对略低。经分析,影响载量的主要因素包含基质种类、微球孔径、配基密度、间隔臂和配基长度等。对于基质种类,聚苯乙烯基质可能孔道结构较为特别。对于微球孔径,应针对不同大小的mRNA分子定制不同孔径的微球,以平衡传质阻力与可及吸附表面积之间的矛盾,从而增大DBC。
关键词亲和层析    mRNA    寡脱氧胸腺苷酸    载量    生物分离    
Binding capacity and mechanism analysis of four Oligo(dT) affinity chromatography resins
TAN Yuanzhi , ZHANG Pengcheng , SUN Yanna , ZHANG Qilei , YAO Shanjing , LIN Dongqiang     
Key Laboratory of Biomass Chemical Engineering of Ministry of Education, College of Chemical and Biological Engineering, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China
Abstract: In order to study binding performance of four Oligo(dT) affinity chromatography resins, static adsorption equilibria, adsorption kinetics and dynamic binding capacities (DBC) were investigated with poly(A) as the model target. The results show that the optimal static adsorption capacities of the four resins were all obtained at 0.6 mol⋅L−1 NaCl and pH 6-7. The Monomix dT20 resin showed the highest static adsorption capacity and poly(A) molecule could diffuse into the pores of resin beads. For Poros Oligo (dT)25, Praesto Jetted (dT)25 and NanoGel dT20, poly(A) molecule mainly bounded to the surface of resin beads, which resulted in a slightly lower static adsorption capacity. The DBC results show that the DBC10% of NanoGel dT20 and Monomix dT20 were relatively high, while those of Poros Oligo (dT)25 and Praesto Jetted (dT)25 were slightly lower. The main factors affecting the binding capacity were found as matrix type, microsphere pore size, ligand density, spacer arm structure and ligand length. Polystyrene-based resins might have special pore structure. For mRNA molecules of varying sizes, resin beads with suitable pore sizes should be tailored to balance mass transfer resistance and effective adsorption surface area to obtain optimal DBC results.
Key words: affinity chromatography    mRNA    Oligo(dT)    binding capacity    bioseparation    
1 前言

近年来新型冠状病毒感染成为危害人类健康的重要事件,疫苗起到了至关重要作用[1]。mRNA疫苗凭借高保护率和快速研发效率,得到了广泛关注[2]。对比灭活和减毒疫苗,mRNA疫苗能精确表达抗原、可产生更为强烈的免疫反应[3];相对DNA疫苗和病毒载体疫苗,mRNA疫苗具有蛋白表达可预测性[4]、低免疫原性[5]、避免宿主基因组整合风险等优势[6];此外,mRNA疫苗生产平台灵活性强、流程易标准化[7]。mRNA不仅可以作为预防疫苗,还可用于很多疾病治疗,例如流感病毒[8]、HIV病毒[9]等引发的传染性疾病,以及非小细胞肺癌、胶质母细胞瘤等癌症[10]。预计2035年mRNA市场将达到230亿美元[11]

mRNA制备包括RNA聚合酶催化下的体外转录反应和下游生物分离纯化[12-13]。T7 RNA聚合酶是使用最为广泛的体外转录反应合成酶[14],但转录后包含较多副产物和残留物,如流产性转录起始物、双链RNA(dsRNA)、酶、转录模板DNA、未反应的核苷酸等[15]。下游生物分离纯化过程通常包含捕获和精制2个阶段[16]。对于复杂的mRNA体外转录混合物体系,由于具有3’末端多聚腺嘌呤核糖核苷酸(poly(A))这一尾部特征结构,高选择性的亲和层析是最适合的捕获方法[17-18]。目前mRNA亲和层析分离采用的配基主要有2种,寡脱氧胸腺苷酸(Oligo(dT))和多尿苷酸(poly(U))。研究表明,对于配基为poly(U)的亲和层析介质,poly(U)与含poly(A)的mRNA结合能力较强,但洗脱时需升温至65 ℃以上才能达到较高的回收率[19],且还需额外添加减少非特异性吸附的物质,如尿素、甲酰胺等[20];对于配基为Oligo(dT)的亲和层析介质,Oligo(dT)吸附mRNA后常温下用去离子水洗脱即可达到87% 的收率[21]。因此,绝大多数商业化mRNA亲和层析介质的配基采用Oligo(dT),表 1汇总了现有Oligo(dT)亲和层析介质的基本信息和动态结合载量情况,表中,dp为介质微球粒径,μm;dpore为介质微球平均孔径,nm;DBC为以层析柱体积为基准计的亲和层析介质动态结合载量,mg⋅mL−1

表 1 常见的商业化Oligo(dT)亲和层析介质 Table 1 Typical commercial Oligo(dT) affinity resins

表 1可见,与文献[26]中蛋白A亲和层析介质50~80 mg⋅mL−1的DBC值相比,现有的Oligo(dT)亲和层析介质的DBC值普遍较低,难以满足规模化mRNA分离的需求[7]。因此,研发高载量的Oligo(dT)亲和层析介质非常重要,但目前缺乏对Oligo(dT) 亲和层析介质载量影响机制的探究。本研究将以poly(A)为模型分子,对比不同的Oligo(dT)亲和层析介质的静态吸附平衡、吸附动力学和DBC等性质,借助激光扫描共聚焦显微镜(CLSM)表征poly(A)在介质微球内的分布,结合理论计算分析介质载量的影响因素及相关机制,为高载量Oligo(dT)亲和层析介质的研发提供依据。

2 材料与方法 2.1 主要材料与仪器

主要试剂:poly(A)(货号P9403,动态光散射测得的水力学直径约为6.8 nm),Sigma-Aldrich公司;Ribogreen荧光染料,上海闪晶分子生物科技有限公司;Poros Oligo (dT)25、Praesto Jetted(dT)25、NanoGel dT20和Monomix dT20等4种Oligo(dT)亲和层析介质的相关信息见表 1。这4种介质的基质种类不同,其中前3种介质的基质材料为聚苯乙烯,第4种介质的基质材料为聚甲基丙烯酸酯。

主要仪器:ÄKTApurifier 10 plus层析系统,GE Healthcare Life Sciences公司;Unano-1000微量分光光度计,杭州优米仪器有限公司;MultiScreenHTS真空抽滤系统(MSVMHTS00)和过滤板(MmtiScreen HTS BV),Millipore公司;恒温混匀仪,杭州奥盛仪器有限公司;Tricorn 5/50层析柱(5 mm×50 mm),Cytiva公司;激光扫描共聚焦显微镜(OLYMPUS IX83-FV3000),Olympus公司;纳米粒度电位分析仪(Malvern Zetasizer Nano-ZS ZEN3600),Malvern公司;压汞仪(AutoPore IV 9510),Micromeritics公司。

2.2 吸附条件筛选方法

考察不同pH值、盐浓度对4种Oligo(dT) 亲和层析介质的吸附性能的影响:5种pH值分别为5.0、6.0、7.0、8.0、9.0;4种氯化钠浓度分别为0、200、400、600 mmol⋅L−1。不同pH值的缓冲液分别为20 mmol⋅L−1的柠檬酸盐缓冲液(pH值为5.0)、20 mmol⋅L−1的磷酸盐缓冲液(pH值分别为6.0和7.0)和20 mmol⋅L−1三羟甲基氨基甲烷(Tris)缓冲液(pH值分别为8.0和9.0)。不同盐浓度的缓冲液由1 mol⋅L−1的NaCl缓冲液与相应无盐缓冲液按不同比例配制而成。

采用96孔过滤板进行静态平衡吸附量Q*测定[27],具体步骤如下:第1步,将poly(A)溶解于缓冲液中,使之质量浓度为1.5 mg⋅mL−1,260 nm波长下精确测定poly(A) 初始质量浓度ρ0(mg⋅mL−1);第2步,用去离子水冲洗亲和层析介质,抽滤15 min,精确称重后转移至量筒内,静置过夜,加入适量的去离子水,配成介质体积比为10%的重悬浮介质匀浆液,将96孔过滤板的每孔加入100 μL (含10 μL介质)该介质匀浆液;第3步,用200 μL缓冲液平衡该介质3次,真空抽滤,去除缓冲液;第4步,将100 μL不同条件下的poly(A)溶液加入过滤板样品孔中,用封板膜密封过滤板的顶部和底部,在25 ℃、1 200 r⋅min−1转速下恒温震荡3 h;第5步,吸附平衡后,真空抽滤,收集滤液,260 nm波长下测定滤液中poly(A)平衡质量浓度ρ*(mg⋅mL−1),根据物料平衡计算亲和层析介质的Q*Q*为以1g介质为基准计的poly(A)静态平衡吸附量,mg⋅g−1

2.3 静态吸附等温线测定方法

测定4种亲和层析介质的吸附等温线的方法如下:将poly(A)溶解于结合缓冲液,制备出质量浓度为4.0 mg⋅mL−1的母液,结合缓冲液含10 mmol⋅L−1 Tris、0.6 mol⋅L−1 NaCl、1 mmol⋅L−1乙二胺四乙酸(EDTA),pH=7.0。然后将母液依次稀释至质量浓度为3.2、2.4、1.6、0.8、0.4、0.2 mg⋅mL−1。用96孔过滤板的每列8个样品孔考察特定的介质,每个浓度使用3个平行孔,每孔加入100 μL重悬浮的介质匀浆液(含介质10 μL),用缓冲液冲洗3次,真空抽滤,去除缓冲液。将100 μL不同质量浓度的poly(A)溶液添加到相应的过滤板样品孔中,密封过滤板,在25 ℃、1 200 r⋅min−1转速下恒温震荡3 h,后续操作参照2.2节进行。用Langmuir-Freundlich方程拟合吸附等温线,具体表达式如下[28]

$ {Q^*} = \frac{{K{\rho ^{ * b}}}}{{1 + K{\rho ^{ * b}}}} \times {Q_{\text{m}}} $ (1)

式中:Qm为最大静态吸附容量,mg⋅g−1K为亲和力常数,(mL⋅mg−1)bb为经验常数。

由于较多的亲和层析介质在poly(A) 的测试质量浓度范围内Q*无法达到吸附等温线的平台区域,因此,本研究以ρ*为1 mg⋅mL−1时对应的静态平衡吸附量QC (mg⋅g−1)为参考,比较各介质对poly(A)的吸附能力[29]

2.4 吸附动力学研究方法

4种亲和层析介质对poly(A)的吸附动力学研究方法如下:96孔过滤板的每孔加入100 μL重悬浮的介质匀浆液(含介质10 μL),共使用6个样品孔。用结合缓冲液洗涤介质3次,将100 μL、ρ0为1.5 mg⋅mL−1的poly(A)溶液添加到1#孔内,用封板膜密封孔的上、下端,25 ℃、1 200 r⋅min−1转速下恒温振荡。以1#孔开始震荡为0时刻,分别在0、20、40、50、55、59 min将相同的poly(A)溶液添加到1~6#孔内,连续恒温振荡孵育共60 min。最后,真空抽滤,收集滤液,测定滤液中poly(A) 质量浓度ρ(mg⋅mL−1),得到ρ/ρ0随时间变化的吸附动力学曲线。

2.5 穿透曲线和动态结合载量测定方法

使用10% 穿透的DBC (DBC10%)来表征4种亲和层析介质在层析柱内的动态吸附性能。Tricorn 5/50层析柱装填约0.5 mL介质,柱高约20 mm。用结合缓冲液充分平衡床层,直至UV260nm响应接近基线,分别在50、100、150 cm⋅h−1等流速下测定poly(A)穿透曲线,poly(A)料液质量浓度为1.0 mg⋅mL−1,按特定时间段分管收集出口样品,260 nm波长下测定收集液中poly(A)质量浓度,设定达到90% 穿透比例时终止上样,绘制穿透曲线,根据DBC10%值来确定亲和层析介质的动态结合载量。

2.6 介质吸附的微观观测

采用CLSM观察poly(A)在4种亲和层析介质中的吸附过程。类似2.4节实验方法,吸附时间分别为1、5、10、20、40、60 min,以未吸附poly(A)的介质微球作为对照组,完成吸附后,真空抽滤。将介质用结合缓冲液冲洗3次,真空抽滤,配制成100 μL匀浆液(含10 μL介质)。取匀浆液10 μL,与100 μL稀释了133倍的Ribogreen染液[30]在25 ℃、1 200 r⋅min−1转速下避光振荡孵育1 h。

用CLSM观察亲和层析介质内poly(A)的分布。选择处于平均粒径附近的介质微球,选取介质微球的最大截面处,采集2维共聚焦图像。镜头选择60倍油镜、激光波长为488 nm、激光强度为饱和能量的0.1%~0.3%、光电倍增管值设为800 V、共聚焦图像的尺寸为1 024像素×1 024像素,图片经ImageJ软件处理。

2.7 静态吸附容量理论计算

以典型的分子大小和平均分子量的mRNA(10 nm和100 kDa,30 nm和300 kDa,40 nm和600 kDa)为模型分子,忽略mRNA分子间的相互作用力和传质阻力,只考虑mRNA水力学直径的影响,并在单分子层吸附前提下,模拟计算亲和层析介质对mRNA的静态吸附容量Qcal(mg⋅g−1),分析dpdporeQcal的影响,并比较多孔微球对mRNA的内表面静态吸附容量Qin和外表面静态吸附容量Qex。计算式如下[28]

$ {a_{{\text{ex}}}}{\text{ = }}\frac{{6 \times (1-\varepsilon )}}{{{d_{\text{p}}}}} $ (2)
$a_{\text {in }}=\frac{4000 \times(1-\varepsilon) \times \varepsilon_{\mathrm{p}}}{d_{\text {pore }}}$ (3)
$Q_{\text {cal }}=4 \times 10^{18} \times \frac{\left(a_{\mathrm{ex}}+a_{\text {in }}\right) \times M_{\mathrm{a}}}{\pi d^2 \times N_{\mathrm{A}} \times m \times \mathrm{CF}}$ (4)

式中:aexain分别为以1 mL柱体积为基准计的微球外、内比表面积,m2⋅mL−1ε为柱空隙率;εp为微球孔隙率;Ma为mRNA的平均分子量,kDa;d为mRNA水力学直径,nm;NA为阿伏伽德罗常数,mol−1m为1 μL介质对应的干重,mg⋅μL−1;CF为柱压缩因子。

3 结果与讨论 3.1 吸附条件筛选

不同pH和NaCl浓度条件下,Poros Oligo (dT)25、Praesto Jetted(dT)25、NanoGel dT20和Monomix dT20等4种亲和层析介质对poly(A)的Q*图 1所示。由图 1可见,4种亲和层析介质对poly(A)的Q*值均随NaCl浓度增大而增大,这主要是因为,NaCl浓度增大对静电作用产生屏蔽效应,减弱了Oligo(dT)配基与poly(A)磷酸基团之间的电荷斥力,两者之间的碱基更容易形成氢键,从而促进了与poly(A)结合。研究中还发现,NaCl浓度过高时,poly(A)易形成沉淀,因此选用0.6 mol⋅L−1作为合适的NaCl上样浓度。由图 1还可见,高NaCl浓度下、pH=6.0~7.0时,4种亲和层析介质对poly(A)均有较高的Q*值。这是因为,弱酸性条件可能降低poly(A)磷酸基团的电离度、减小核酸带电荷量,促进Oligo(dT)配基与poly(A)之间的氢键形成。由图 1还可见,低NaCl浓度下、pH=5.0或pH=9.0时,Q*值急剧下降。可能由于在较强的酸性条件下(pH=5.0),碱基中的N原子被质子化,氢键形成更加困难;而在碱性条件下(pH=9.0),poly(A)的磷酸基团所带的负电荷量增大,Oligo(dT)配基与poly(A)之间的电荷排斥作用增强,导致与poly(A)难以结合。

图 1 不同pH和NaCl浓度条件下4种亲和层析介质对poly(A)的Q*比较 Fig.1 Poly(A) adsorption capacities of the four affinity resins under different pH and NaCl concentrations

基于上述不同pH和NaCl浓度下的Q*值分析,可确定4种亲和层析介质合适的上样条件均为NaCl浓度为0.6 mol⋅L−1、pH值为6.0~7.0。

3.2 静态吸附等温线及模型拟合

基于3.1节的实验结果,为了比较不同亲和层析介质的Qm,如图 2所示,测定了pH=7.0、0.6 mol⋅L−1 NaCl条件下4种亲和层析介质的吸附等温线,并采用Langmuir-Freundlich方程进行拟合,得到的拟合参数列于表 2

图 2 4种亲和层析介质对poly(A)的吸附等温线及Langmuir- Freundlich模型拟合曲线(pH =7.0、0.6 mol⋅L−1 NaCl) Fig.2 Poly(A) adsorption isotherms of the four affinity resins at pH=7.0 and 0.6 mol⋅L−1 NaCl and the corresponding Langmuir-Freundlich model fitting profiles
表 2 4种亲和层析介质的吸附等温线Langmuir- Freundlich模型拟合参数 Table 2 Fitting results of adsorption isotherms of the four affinity resins with Langmuir-Freundlich model

图 2可见,Q*ρ*增大而变大,且增长幅度逐渐变小,但吸附等温线最终并没有达到平稳阶段,这可能是核酸特有的吸附现象。随着更多的poly(A)被吸附,介质微球表面所带负电荷量增加,对溶液中游离的poly(A)静电斥力增强,且在吸附接近饱和时,核酸分子之间的空间位阻对poly(A)的吸附行为影响较大。因此,吸附等温线并不符合Langmuir方程[31],但Langmuir-Freundlich方程拟合效果较好[21]

表 2可见,Poros Oligo (dT)25和Praesto Jetted(dT)25这2种亲和层析介质的静态吸附容量较低(QC分别为4.9和6.1 mg⋅g−1),这可能是由于其dpore相对较大,导致其可及吸附表面积减小。由表 2还可见,相比于其他3种亲和层析介质,Praesto Jetted(dT)25的K值(0.578) 最小,且QC/Qm值小于40%,需要更高的poly(A) 质量浓度来达到较大的Q*值,可能是介质的配基密度、间隔臂等因素导致其对poly(A)的亲和力较弱。由图 2可见,当ρ*较高时(ρ* > 2.86 mg⋅mL−1),Poros Oligo (dT)25介质的Q*有较大幅度增大,这说明高ρ*值可能导致吸附机理发生改变[21]

表 2可见,Monomix dT20和NanoGel dT20这2种亲和层析介质的静态吸附容量较大(QC分别为10.2和9.0 mg⋅g−1)。经分析,主要有以下2种解释:一是poly(A)可扩散进入这2种介质微球的孔道内,而且由于其dpore较小,可及吸附表面积大,导致静态吸附容量较高;二是poly(A)难以扩散至介质微球内部孔道,主要在微球表层吸附,由于Monomix dT20的dp(30 μm)比其他3种亲和层析介质(均为50 μm)小,故拥有较大的比表面积,从而静态吸附容量最大,而NanoGel dT20可能配基密度较高,表面可及吸附位点多,导致较大的静态吸附容量。这2种亲和层析介质的K值均接近1.00、QC/Qm值接近50%,对poly(A)的亲和性较强。原因可能是,这2种亲和层析介质的配基为dT20,链长小于Poros Oligo (dT)25和Praesto Jetted(dT)25介质的dT25,所带负电荷量较小,对poly(A)的排斥力较小,故亲和力较强。此外,间隔臂分子结构及其长度等因素也可能影响亲和层析介质的亲和力[21]

3.3 吸附动力学

为了进一步探究poly(A)在4种亲和层析介质微球中吸附行为的差异,考察pH=7.0、0.6 mol⋅L−1 NaCl条件下4种亲和层析介质对poly(A)的吸附动力学,结果如图 3所示。

图 3 4种亲和层析介质对poly(A)吸附动力学曲线比较(pH=7.0、0.6 mol⋅L−1 NaCl) Fig.3 Poly(A) adsorption kinetics of the four affinity resins at pH 7.0 and 0.6 mol⋅L−1 NaCl

图 3可见,Poros Oligo (dT)25、Praesto Jetted(dT)25和NanoGel dT20这3种亲和层析介质吸附poly(A)过程中,ρ/ρ0变化主要集中在前1 min。经推测,介质与poly(A)结合主要为对流传质主导的微球表层吸附,而微球内部扩散传质主导的孔内吸附较少,因而传质阻力小,达到吸附平衡所需时间短。由图 3还可见,Monomix dT20吸附poly(A)过程中,ρ/ρ0的大幅度变化持续了约20 min,40 min后趋于稳定,达到吸附平衡。这表明,在Monomix dT20介质中可能同时存在poly(A)的表层吸附和深层孔扩散吸附,而微球内部传质阻力较大,达到吸附平衡时间较长。相比于其他3种介质,dpore最小的Monomix dT20介质中存在poly(A)的深层孔扩散吸附,可能与其聚甲基丙烯酸酯的基质材料有关。由图 3还可见,在前1 min内,NanoGel dT20介质溶液的ρ/ρ0变化最大,可能是由于该介质的配基链长、间隔臂长度等因素导致介质与poly(A)的亲和性更强;此外,配基密度高也可使该介质吸附poly(A)分子多。

3.4 动态结合载量

采用DBC10%表征4种亲和层析介质在层析柱内分离过程的动态吸附性能,考察流速对亲和层析介质动态吸附过程的影响,并用DBC10%/Q (Q为上样条件下的静态平衡吸附量,mg⋅mL−1)表征传质阻力。3种流速下NanoGel dT20的穿透曲线、4种亲和层析介质在pH=7.0和0.6 mol⋅L−1 NaCl条件下的DBC10%和DBC10%/Q实验结果见图 4

图 4 NanoGel dT20穿透曲线及4种亲和层析介质吸附poly(A)的动态吸附性能比较(pH=7.0、0.6 mol⋅L−1 NaCl) Fig.4 Breakthrough curves of the NanoGel dT20 resin and dynamic poly(A) adsorption performance of the four affinity resins at different flow rates (pH=7.0, 0.6 mol⋅L−1 NaCl)

图 4(b)(c)可见,NanoGel dT20和Monomix dT20这2种亲和层析介质对poly(A)的DBC10%值较高,且受流速影响较明显,DBC10%/Q随流速增加而大幅度下降。由前文可知,Monomix dT20的Q值比NanoGel dT20高,但图 4(b)显示DBC10%值却与NanoGel dT20接近,可能由于Monomix dT20介质的dpore相对较小,大部分poly(A)分子由于停留时间短、扩散传质阻力大等原因而未能扩散至介质微球内部孔中,仅在微球表层吸附,导致DBC10%没有明显高于NanoGel dT20;而且,随着流速增大,Monomix dT20介质中的poly(A)的扩散时间缩短,导致其DBC10%/Q大幅度下降。而NanoGel dT20仅依靠微球表层的poly(A)吸附就能达到较高的DBC10%值,这可能与其具有比Monomix dT20稍大的dpore、较小的扩散传质阻力、较大的可及吸附表面积有关,此外配基密度、配基长度和间隔臂等性质也会影响其DBC10%,该结果与3.3节的推论相符。至于NanoGel dT20的DBC10%/Q受流速影响较大,分析原因可能是由于介质配基密度较高,导致基球带电荷量较大,对poly(A)的静电排斥力更强,影响了配基对poly(A)的吸附动力学,故传质阻力更大,吸附所需时间更长。正如Vanjur等[31]报道,固定在表面的DNA探针密度会影响其与目标互补链的静电斥力,改变吸附平衡和吸附动力学。

图 4(b)(c)还可见,Praesto Jetted(dT)25和Poros Oligo (dT)25这2种亲和层析介质对poly(A)的DBC10%相对略低,这可能与其dpore较大导致的可及吸附表面积较小有关。由3.2节可知,Praesto Jetted(dT)25的Q值高于Poros Oligo (dT)25,但图 4(b)显示DBC10%值却较小,可能也是由于微球表面高配基密度影响了配基对poly(A)的吸附动力学。由图 4(c)可见,随着流速增加,这2种亲和层析介质的DBC10%/Q值变化幅度不大,表明传质阻力并没有随流速的增加而明显增加,推测是由于这2种亲和层析介质对poly(A)的吸附主要为表层吸附,扩散传质所占比例较小,总传质速率受流速影响较小。

图 4(c)还可见,在低流速下(50 cm⋅h−1),Poros Oligo (dT)25、Praesto Jetted(dT)25和NanoGel dT20这3种亲和层析介质的DBC10%/Q值都接近70%,且均高于Monomix dT20,表明这3种亲和层析介质的传质阻力较小、总传质速率较高,进一步推测,这3种亲和层析介质对poly(A)的吸附主要为对流传质主导的表层吸附,而Monomix dT20介质则主要为表层吸附和微球深层孔扩散吸附,与3.3节的结论一致。

3.5 CLSM结果及分析

借助CLSM分析,从微观视角考察4种亲和层析介质微球中poly(A)的分布状态及其随时间变化情况,结果如图 5所示。结合此宏观吸附实验结果分析不同亲和层析介质的吸附特性。

图 5 4种亲和层析介质吸附poly(A)随时间变化的CLSM结果 Fig.5 CLSM profiles of poly(A) adsorption as a function of time by the four affinity resins

图 5(a)~(c)可见,绿色荧光主要分布在介质微球表层,表明poly(A)主要吸附在Poros Oligo (dT)25、Praesto Jetted(dT)25和NanoGel dT20这3种亲和层析介质的外表层,且1 min之后荧光强度没有明显变化,与3.3节结果一致,可能原因是具有较大dpore的聚苯乙烯微球内部存在较多狭窄孔道,从而阻碍了poly(A)的微球内部孔扩散。对于Monomix dT20介质(见图 5(d)),随着吸附时间延长,荧光呈环状逐渐向内扩展,表明poly(A)逐渐扩散至微球内部;20 min后微球荧光强度分布基本稳定,达到吸附平衡,与3.3节的吸附动力学变化规律一致。

3.6 静态吸附容量理论计算及分析

静态吸附容量是影响介质DBC的重要参数,为了更好地探究亲和层析介质载量的主要影响因素,对不同dpdpore下亲和层析介质微球对mRNA的Qcal进行了理论计算及分析。

针对3种不同水力学直径的mRNA,在ε=0.4、m=0.6 mg⋅μL−1、CF=1.2条件下,且介质无孔,Qcal~dp的理论计算结果如图 6(a)所示。由图 6(a)可见,在dp=5~50 μm时,随着dp增大,Qcal下降,且Qcal值均小于3 mg⋅g−1,这是因为,对于无孔微球,mRNA仅存在表面吸附,dp越大,外表面积相对越小,从而导致较低的吸附容量。由图 6(a)还可见,mRNA的水力学直径很小时(10 nm),Qcal值较大,这是因为,较小的mRNA分子占据空间小,同样的外表面积可吸附数量更多的mRNA分子,从而Qcal值较大。由图 6(a)Qcal值可知,仅靠介质微球的表面吸附无法达到较高的mRNA静态吸附容量。

图 6 介质微球的dpdpore对mRNA的Qcal影响的理论计算结果 Fig.6 Theoretical Qcal calculation results for mRNA in resins with different dp and dpore

对于多孔亲和层析介质,假设εp= 0.5、mRNA分子均能扩散进入孔内且占据所有孔内表面,以dp=30 μm的微球为例,微球内、外表面对mRNA的Qcal~dpore理论计算结果如图 6(b)所示;针对3种不同水力学直径的mRNA,Qcal~dpore理论计算结果如图 6(c)所示。由图 6(b)可见,dpore=100~1 000 nm时,多孔介质微球的QinQex的10~100倍,因此,增加微球内孔的可及吸附表面积对提升介质微球对mRNA的静态吸附容量至关重要。由图 6(c)可见,随着dpore增大,Qcal下降显著,较大的mRNA分子(30 nm和40 nm)在介质中的Qcal=1~14 mg⋅g−1,而最小的mRNA分子(10 nm) Qcal=4~35 mg⋅g−1。这是因为,dpore对介质的可及吸附表面积影响较大,dpore增大时,会导致介质微球可及吸附表面积变小,从而导致Qcal值变小。在实际吸附过程中,mRNA分子并不能扩散进入介质微球孔内,孔内的可及吸附表面积还与mRNA分子大小有关,dpore过小时,因大分子的mRNA孔扩散传质受到阻碍,可及吸附表面积减小,从而导致Qcal值减小。因此,针对不同大小的mRNA分子应定制不同孔径的微球,以达到较大的静态吸附容量和动态结合载量。

4 结语

(1) 以poly(A)为模型分子,考察了4种Oligo(dT)亲和层析介质对poly(A)的吸附特性,发现最佳吸附条件均为高盐浓度和pH=6~7;

(2) 4种介质中,Monomix dT20介质的静态吸附容量最大,且poly(A)能扩散至其深层孔内,而其他3种介质中poly(A)均主要为表层吸附,静态吸附容量稍低,与CLSM荧光分布结果一致,这可能与基质材料有关。然而,Monomix dT20介质的DBC10%相对并不显著的大,可能是由于其dpore相对较小导致扩散传质阻力较大;

(3) NanoGel dT20介质与Monomix dT20介质相比,dpore稍大,扩散传质阻力小,可及吸附表面积大,两者对poly(A)的DBC10%值接近,均较高;而Poros Oligo (dT)25和Praesto Jetted(dT)25这2种介质的dpore偏大,可及吸附表面积偏小,DBC10%相对略低;

(4) 比较不同亲和层析介质的吸附特性,影响载量的主要因素有基质种类和dpore,其他因素包括配基密度、间隔臂、配基长度等。对于基质种类,聚苯乙烯基质可能孔道结构较为特别,内部存在较多狭窄孔道,导致孔扩散吸附较少,降低了Qm,但其对DBC的影响有待进一步探究;对于dpore,需要针对不同大小的mRNA分子定制不同孔径的微球,以平衡扩散传质阻力与可及吸附表面积之间的矛盾,从而有效增大静态吸附容量和动态结合载量。此外,由于本研究使用的poly(A)分子直径较小,与长链mRNA的吸附行为可能存在一定差异,相关影响有待深入研究。

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