高校化学工程学报    2018, Vol. 32 Issue (4): 823-830  DOI: 10.3969/j.issn.1003-9015.2018.04.011
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引用本文 

余园园, 杨犁, 彭昌军, 孙炜. 分子动力学模拟不同类型MOFs材料对NO2气体扩散影响[J]. 高校化学工程学报, 2018, 32(4): 823-830. DOI: 10.3969/j.issn.1003-9015.2018.04.011.
YU Yuan-yuan, YANG Li, PENG Chang-jun, SUN Wei. Molecular Dynamic Simulation on Effects of MOFs Type on NO2 Diffusivity[J]. Journal of Chemical Engineering of Chinese Universities, 2018, 32(4): 823-830. DOI: 10.3969/j.issn.1003-9015.2018.04.011.

基金项目

国家自然科学基金(21406172);湖北省自然科学基金(2016CFB388)。

通讯联系人

杨犁, E-mail:liyang@wit.edu.cn

作者简介

余园园(1991-), 女, 湖北钟祥人, 武汉工程大学硕士生。

文章历史

收稿日期:2017-12-25;
修订日期:2018-03-26。
分子动力学模拟不同类型MOFs材料对NO2气体扩散影响
余园园 1, 杨犁 1, 彭昌军 2, 孙炜 1     
1. 武汉工程大学 绿色化工过程教育部重点实验室和湖北省新型反应器与绿色化学工艺重点实验室,化工与制药学院,湖北 武汉 430205;
2. 华东理工大学 化学与分子工程学院,上海 200237
摘要:利用分子动力学模拟考察了不同浓度条件下NO2气体在金属有机骨架材料(MOFs)中的自扩散速率,并讨论了气体自扩散速率与材料结构之间的关系。研究结果表明NO2气体在IRMOF系列材料、具有开放金属位点的MOFs材料和ZIF系列材料中的自扩散系数随着气体浓度增加先升高后降低;在MIL系列材料中的自扩散系数仅随着气体浓度增加而降低。其扩散性能主要受材料最小孔径和孔隙率影响,在同系列材料中最小孔径和孔隙率越大,NO2气体的自扩散系数越大。其中NO2气体在IRMOF-9、MgMOF-74、ZIF-3、MIL-47和MIL-53Crht等材料中均具有较好扩散性能。通过气体分子在材料中的径向分布函数图、模拟轨迹等探讨了气体在MOFs材料中的扩散机理。研究发现MOFs材料金属簇吸附性能的强弱影响NO2气体随浓度变化的自扩散系数曲线。同时研究了无限稀释条件下NO2气体在MOFs材料中的自扩散系数D(0),从而获得NO2在MOFs材料中的活化能。
关键词分子动力学模拟    自扩散系数    MOFs材料    NO2    
Molecular Dynamic Simulation on Effects of MOFs Type on NO2 Diffusivity
YU Yuan-yuan1, YANG Li1, PENG Chang-jun2, SUN Wei1    
1. Key Laboratory of Green Chemical Process of Ministry of Education, Key Laboratory of Novel Reactor and Green Chemical Technology of Hubei Province, School of Chemical Engineering and Pharmacy, Wuhan Institute of Technology, Wuhan 430205, China;
2. School of Chemistry and Molecular Engineering, East China University of Science and Technology, Shanghai 200237, China
Abstract: NO2 self-diffusivity in metal-organic frameworks (MOFs) was studied via molecular dynamics (MD) simulation under different molecular concentrations, and effects of material geometry was analyzed. The results show that NO2 self-diffusivity increases first and then decreases with the increase of NO2 concentration in IRMOF, open-metal sites and ZIF MOFs, and it decreases linearly with the increase of NO2 concentration in MIL MOFs. The self-diffusivity behaviors are mainly affected by pore limiting diameter and void fraction of MOFs. Higher self-diffusivities of NO2 were obtained in MOFs with larger pore limiting diameters and void fractions. IRMOF-9, MgMOF-74, ZIF-3, MIL-47 and MIL-53Crht showed good diffusion performance of NO2 gas. Diffusion mechanism was studied by radial distribution functions and MD trajectory of NO2 gas in MOFs. The results show that self-diffusion coefficients of NO2 gas are affected by the interaction of metal cluster of MOFs and NO2 molecule. Activation energies of NO2 in MOFs are obtained through fitting simulated self-diffusivities at infinite dilution D(0) at various temperatures using Arrhenius equation.
Key words: molecular dynamics simulation    self-diffusivities    MOFs materials    NO2    
1 前言

近年随着尾气排放量和化石燃料燃烧量的增加,大气污染日趋严重。其中NO2是主要的污染物之一,是形成大气气溶胶、酸雨和对流层臭氧的主要因素[1],对人体健康和环境有很大的危害性,例如20 µg·g-1的NO2就可以对人体造成伤害[2]。过去的几十年中,我国NO2排放量的增长幅度在所有污染气中是最快的[3]。因此治理NO2的污染是一个紧迫的问题。其中一个有效的方法就是在NO2排放过程中通过吸附脱附将其回收利用。所以探索性研究NO2在吸附材料中的物理化学性能是十分必要的。

本研究主要探讨了NO2在MOFs材料中的扩散性能。MOFs作为一种新型纳米多孔材料,具有高孔隙率、低密度以及孔道可调性能,在气体储存、分离、催化和分子传感等领域具有广阔的应用前景[4]。国内外学者对气体分子在MOFs、沸石等材料中的吸附和分离性能进行了研究,但对于气体分子的动力学扩散过程研究较少,特别是NO2气体,中高继贤等[5]模拟研究了烟气中不同体积分数的SO2在ZL50活性炭中的扩散过程,结果表明SO2的有效内扩散系数随着SO2体积分数、吸附时间的增加不断增大。王鹏等[6]利用Fick扩散模型进行了CH4/N2在炭分子筛上的吸附动力学模拟,研究发现N2的扩散速率大于CH4的扩散速率。吴迪等[7]模拟研究了CH4在纳米多孔碳材料中的扩散行为,研究发现密度越小自扩散系数越大,且羧基修饰后自扩散系数最大。Liu等[8]模拟研究了氢气在10种IRMOF材料中的扩散速率,发现氢气在材料中的扩散系数与材料的自由体积成正比。Zhang等[9]模拟研究了纯CO2、CH4气体和混合气体在ZIF-8材料中的吸附和扩散,结果表明CO2的扩散性能受CH4影响很小,但是CH4的扩散系数随CO2浓度增大而减小。Yang等[10]模拟研究了甲醇、甘油和混合气体在IRMOF-1材料中的吸附和扩散,研究发现当甲醇的浓度增加时甘油的自扩散系数增加,协同促进效应增强。在分子水平上研究气体分子在MOFs材料中的扩散行为与其结构关系,不仅可为MOFs材料在气体吸附、分离等方面提供理论依据,还可为MOFs材料的分子设计和工艺开发提供科学技术指导。本研究通过分子动力学(MD)模拟研究NO2气体在多种MOFs材料中的分子动力学扩散过程,重点讨论自扩散系数与不同MOFs材料构效关系,并揭示NO2气体在MOFs材料中的扩散机理。

2 模拟方法

根据前期吸附模拟工作结果,本文选择18种对NO2吸附性能好的MOFs材料作为本次研究对象,重点考察NO2在这些材料中的扩散性能。吸附性能好的MOFs材料筛选标准是常温常压下吸附容量大[11]。所选MOFs材料分别为Cd3BTB2、IRMOF-4、IRMOF-9、IRMOF-11、IRMOF-13[12]、MgMOF-74[13]、Mg-DOBDC、MIL-140B、MIL-47[14]、MIL-53Crht[15]、MIL-88A-dry、ZIF-2[16]、ZIF-3、ZIF-69[17]、ZIF-9、ZnBDC、ZnMOF-74和Zn-DOBDC[18]。由前期吸附模拟结果可知DREIDING力场参数[19]和UFF力场参数[20]可以很好模拟刚性MOFs材料物理化学性能,其具体力场参数见表 1。NO2的力场参数采用刚性分子模型,其具体力场参数和分子几何结构见表 2[21]。本研究中分子间的相互作用能U由Lennard-Jones势能和静电作用势能组成[22],公式如下:

表 1 MOFs材料的Lennard-Jones势能参数 Table 1 Lennard-Jones potential parameters of MOFs
表 2 NO2的Lennard-Jones势能参数和分子几何构型 Table 2 Lennard-Jones potential parameters and geometry of NO2
$U = \sum 4 {\varepsilon _{ij}}\left[ {{{\left( {\frac{{{\sigma _{ij}}}}{{{r_{ij}}}}} \right)}^{12}} - {{\left( {\frac{{{\sigma _{ij}}}}{{{r_{ij}}}}} \right)}^6}} \right] + \sum {\frac{{{q_i}{q_j}}}{{4\pi {\varepsilon _{\rm{0}}}{r_{ij}}}}} $ (1)

其中,εijσij是LJ阱深和LJ直径,riji原子和j原子的距离,qii原子的电荷,ε0是真空介电常数。不同原子间Lennard-Jones势能参数由Lorentz-Berthelot混合规则[22]给出。

本研究采用MD模拟计算NO2分子随浓度变化在MOFs材料中的扩散系数。MD模拟均使用GROMACS软件包[23]在温度为298 K下正则系综(canonical ensemble,NVT)计算所得。其中模拟盒子采用MOFs材料的晶体参数构建,并在周期性边界条件下运用跳蛙(leap-frog)算法求解运动方程,温度采用Nosé-Hoover方法控制[22]。每个系统的模拟时间至少为10 ns,每一步积分步长为1 fs,其中前8 ns作为平衡时间,后2 ns为统计平均计算。Lennard-Jones势能采用Switch方法计算[22],其截断半径为1.1 nm。静电势能采用particle-mesh-ewald (PME)方法计算[24],其截断半径为1.1 nm。NO2采用刚性分子模型,其几何构型采用线性限制算法(LINCS)方法控制[25]。MOFs材料的原子固定不动,作为静止的原子固定在晶格参数位点上。自扩散系数Ds使用爱因斯坦关系式[10]由均方位移计算如下:

$ {D_{\rm{s}}} = \mathop {\lim }\limits_{t \to \infty } \frac{1}{{6t}}\left[ {\frac{1}{N}{{\sum\limits_{k = 1}^N {\left| {{r_k}\left( t \right) - {r_k}\left( 0 \right)} \right|} }^2}} \right] $ (2)

其中,rk(0)和rk(t)分别为第k 个分子在初始时刻0和t时刻的位置,N为分子的总数。其中计算NO2气体随浓度变化的自扩散系数时气体分子间相互作用是打开。当计算无限稀释条件下NO2自扩散系数时气体分子间的相互作用关闭。

无限稀释条件下NO2自扩散系数是随温度变化的函数,其数值和活化能相关。本研究在温度从350到600 K的变化范围内模拟不同温度下的无限稀释自扩散系数D(0),并利用阿伦尼乌斯关系式[26]计算得到NO2气体在MOFs材料中的活化能Ea

$ D\left( 0 \right) = {D_{\rm{f}}}\exp \left( {\frac{{ - {E_{\rm{a}}}}}{{RT}}} \right) $ (3)

其中Df是指前因子,R是理想气体常数。

3 结果与讨论 3.1 NO2气体在MOFs材料扩散性能

根据MOFs材料的结构特点分类比较NO2扩散性能。图 1是在18种MOFs材料中NO2气体自扩散系数随浓度变化曲线。其中MOFs材料的几何性质利用Zeo++程序计算获得[27],如表 3所示,依据MOFs材料的VF(孔隙率,void fraction)从大到小排列。

图 1 温度298 K时NO2在MOFs材料中自扩散系数曲线 Fig.1 Self-diffusivities of NO2 in MOFs at 298 K
表 3 MOFs的几何结构性能 Table 3 Geometrical properties of MOFs

图 1(a)是IRMOF (iso-reticular metal-organic frameworks)系列的MOFs材料,其中IRMOF-9,IRMOF-11和IRMOF-13是互穿结构。从图 1(a)可知在这三种材料中NO2气体的自扩散系数随着气体浓度增加先升高后降低。在NO2气体浓度为0.01~7.5 mmol·g-1时,因为MOFs材料表面吸附位点作用,NO2气体被束缚在材料孔道内表面。随着气体浓度的增加分子协同效应加剧,NO2气体受MOFs材料束缚减弱,因此自扩散系数随着浓度增大而升高。当NO2气体浓度大于7.5 mmol·g-1时,NO2气体的空间位阻效应增加,此时分子自扩散速率随着吸附浓度的增大逐渐减小。其中NO2在IRMOF-9中的自扩散系数相比其它三个材料要大,其最大自扩散系数可达10.2×10-9 m2·s-1。因为在这四种材料中IRMOF-9具有最大的SASA(可及表面积,accessible surface area)为3778 m2·g-1VF为0.39和PLD(最小孔径,pore limiting diameter)为0.86 nm。IRMOF-13和IRMOF-11具有相同的几何结构性质,因此自扩散曲线保持一致。而IRMOF-4由于其SASAVF相对最小,且PLD仅仅0.34 nm,所以NO2气体在其中处于束缚状态,其自扩散系数在(0.1~0.4)×10-9 m2·s-1区间之中。

图 1(b)是具有开放金属位点的MOFs材料,其中XMOF-74和X-DOBDC (X = Mg,Zn)框架结构类似,仅仅晶胞三边长度有所差异。其扩散性能也随着NO2气体的浓度增加先升高后降低。这四种材料的孔道都是规整的六边形结构,有机连结体都是苯环,金属簇结构一样,因此VF和孔径性质相似。所以NO2气体在这四种材料中的扩散速度主要由开放金属位点决定。从图 1(b)可知,在这四种材料中NO2气体浓度大于2 mmol·g-1时的自扩散系数范围大约在(2~7.6)×10-9 m2·s-1。其中NO2气体在ZnMOF-74和Zn-DOBDC材料中的扩散速率稍小,表明Zn金属对NO2气体的束缚较大。而另外两种具有开放金属位点的材料Cd3BTB2和ZnBDC表现出不同于以上4种材料的扩散性能,其主要原因是其框架几何结构不同。其中NO2气体在ZnBDC中表现为自扩散系数快速上升和快速下降趋势,其主要原因是VF较小,空间位阻效应随浓度增加快速显现出来。

图 1(c)是ZIF (zeolitic imidazolate frameworks)系列的MOFs材料,同样可知NO2气体在材料中的自扩散系数随着气体浓度增加先升高后降低。在这四种材料中NO2气体浓度大于1 mmol·g-1时自扩散系数范围大约在(0.2~6)×10-9 m2·s-1。其中NO2在ZIF-3中的自扩散系数最大,主要是因为ZIF-3具有最大的SASA为2897 m2·g-1VF为0.21和PLD为0.57 nm。然而ZIF-9具有最小的SASAVF,且PLD仅仅0.25 nm。又因为NO2分子的动态直径为0.401~0.512 nm[28],所以NO2气体在ZIF-9中束缚不动。由此可知NO2气体在此类材料中的扩散受PLD大小束缚,且扩散速率随着VF的增大而升高。

图 1(d)是MIL (materials institute lavoisier)系列的MOFs材料。模拟结果表明NO2气体在MIL系列材料中的自扩散系数随着气体浓度增加而降低,其中,在MIL-47和MIL-53Crht两种材料中NO2气体的扩散能力基本一致。两种材料的几何结构参数SASAVF、PLD和LCD都比较相近,且都是通过苯环结构的连接体相连,仅仅是配位中心的金属元素分别是V和Cr。从扩散性能可以发现,金属配位中心和苯环连接体对NO2气体的束缚能力很差,使得NO2能够自由地在MIL-47和MIL-53Crht材料中的一维孔道中扩散。随着NO2气体浓度的升高,空间位阻效应增大,扩散速度随之减慢。在本研究的所有材料中,NO2气体在MIL-47和MIL-53Crht两种材料中扩散性能最佳,其最大值均大于30×10-9 m2·s-1。NO2气体在MIL-140B材料中自扩散系数趋势和以上两个材料一致,但是由于MIL-140B的VF下降到0.05,且最小孔径PLD为0.40 nm,因此扩散速率明显降低。当NO2气体在MIL-88A-dry材料中的时候,因为其最小孔径PLD仅为0.24 nm,小于NO2分子的动态直径为0.401~0.512 nm。因此NO2气体在MIL-88A-dry中束缚不动。

研究还考察了NO2在这18种MOFs材料中的无限稀释自扩散系数D(0)随温度的变化,并通过阿伦尼乌斯关系式(式(3))计算得到DfEa的数值,结果如表 4所示。无限稀释自扩散系数与温度关系如图 2所示,分别给出了以上4类MOFs材料的变化趋势。

表 4 NO2在MOFs材料中活化能和指前因子 Table 4 Activation energies and pre-factors of NO2 in MOFs
图 2 无限稀释自扩散系数与温度关系图 Fig.2 Relationship between self-diffusivity at infinite dilution and temperature
3.2 NO2气体在MOFs材料中扩散机理分析

NO2气体在MOFs材料中随气体浓度的变化表现出了不同的扩散性能。通过对模拟轨迹的分析,得到NO2气体在不同的MOFs材料中的原子间距离随时间变化谱图和径向分布函数图(RDF),从而揭示其扩散机理。选取了两种不同的MOFs材料作为分析对象,分别是IRMOF-9和MIL-53Crht两种材料。NO2气体在其中表现出不同的自扩散性能,在IRMOF-9材料中自扩散系数随着气体浓度增加先升高后降低,而在MIL-53Crht材料中NO2气体自扩散系数随浓度增大而降低。

通过观察低浓度时的MD模拟轨迹发现,在IRMOF-9材料中NO2气体(10个NO2气体分子在3×2×2的IRMOF-9超晶胞里面,0.21 mmol·g-1)会长时间束缚在材料的吸附位点附近振动。分析此时NO2的N原子与IRMOF-9的Zn原子的距离随时间变化谱图如图 3(a),可以发现谱图振荡的频率较低,在多数时间段里Zn-N的相对距离保持恒定,自扩散系数为4.82×10-9 m2·s-1。表明低浓度的NO2气体在IRMOF-9中扩散时会束缚在不同的吸附位点,摆脱后又立即被另一吸附位点束缚住。随着NO2气体浓度的增加协同效应显著,如图 3(b)高浓度NO2气体在IRMOF-9材料(100个NO2气体分子在3×2×2的IRMOF-9超晶胞里面,2.1 mmol·g-1)中Zn-N距离随时间变化谱图。此时谱图振荡的频率增强,NO2气体在IRMOF-9材料中扩散时束缚明显缩短,自扩散系数增大为8.34×10-9 m2·s-1。分析NO2气体与IRMOF-9材料中Zn原子的RDF曲线可以得出相同的结论。如图 3(c)所示,低浓度的NO2气体在IRMOF-9材料的RDF曲线为Zn-N-10短点线和Zn-O-10实线。此时RDF曲线震荡幅度较大,表现为固相的曲线特征,NO2气体原子相对Zn原子分布处于相对固定的位置,说明NO2气体的自扩散速率较慢。高浓度的NO2气体在IRMOF-9材料的RDF曲线为Zn-N-100虚线和Zn-O-100点线。此时RDF曲线震荡幅度明显减弱,表现为气相的曲线特征,说明NO2气体的自扩散速率变快。

图 3 NO2气体在IRMOF-9中的原子间距离随时间变化谱图(a,b)和径向分布函数图(c) Fig.3 Atom distance as a function of time (a, b) for NO2 in IRMOF-9 and RDF (c)

NO2气体在MIL-53Crht材料表现出不同的扩散性能。从图 4(a)(b)不同浓度NO2气体在MIL-53Crht材料(10个和100个NO2气体分子在3×4×8的MIL-53Crht超晶胞里面,浓度分别为0.11和1.1 mmol·g-1)中Cr-N距离随时间变化谱图的振荡频率基本相同,说明在任何浓度下,NO2气体在MIL-53Crht中的自扩散性能,不受其吸附位点的约束。通过模拟轨迹的观察同样可知,此时NO2气体在MIL-53Crht中无论浓度高低都在自由运动。同时由图 4(c)的RDF曲线可知,在高低浓度时Cr-N-10短点线和Cr-N-100虚线,以及Cr-O-10实线和Cr-O-100点线基本重合,说明NO2气体不受附位点束缚表现为相同的气相流动性质。因此NO2气体在MIL-53Crht材料的自扩散系数主要受空间位阻效应影响,随浓度增大而降低。

图 4 NO2气体在MIL-53Crht中的原子间距离随时间变化谱图(a,b)和径向分布函数图(c) Fig.4 Atom distance as a function of time (a, b) for NO2 in MIL-53Crht and RDF (c)

图 5表示NO2在IRMOF-9和MIL-53Crht材料的吸附密度图和MD模拟截图。通过前期的MC模拟结果分析可得吸附密度图,图 5(a)(c)表示NO2在IRMOF-9和MIL-53Crht单晶胞中的高吸附位点(黑色密度云),吸附密度云越大表明该位置吸附NO2气体几率越高。由图 5(a)可知,IRMOF-9材料吸附NO2气体的吸附位点主要在Zn金属簇周围,MD模拟截图图 5(b)同样证明NO2气体束缚位点就是IRMOF-9材料高吸附位点。由图 5(c)可知,MIL-53Crht材料吸附NO2气体的吸附位点主要在一维孔道中心靠近苯环的平面,且吸附密度云的大小分散平均。此时表明Cr金属簇对NO2气体吸附能力较弱,因此NO2气体受高吸附位点影响较小。从MD模拟截图图 5(d)可见,NO2气体在孔道中心自由移动,并没有停留在某一个吸附位点附近。通过以上分析表明,当MOFs材料存在强金属簇吸附位点的时候,NO2气体受到吸附位点影响,先表现出协同促进效应自扩散速率随浓度增加而增大,后表现为空间位阻效应自扩散速率随浓度增加而减小。如果MOFs材料没有强吸附位点的时候,NO2气体不受到吸附位点影响,仅仅表现为空间位阻效应自扩散速率随浓度增加而减小。

图 5 NO2在IRMOF-9和MIL-53Crht材料吸附密度图(a,c)和MD模拟截图(b,d) Fig.5 Adsorption density diagrams (a, c) and snapshot of MD simulation (b, d) for NO2 in IRMOF-9 and MIL-53Crht
4 结论

本研究利用MD模拟研究了NO2气体在18种MOFs材料中随浓度增加的自扩散性能,并分析了NO2气体在MOFs材料中的扩散机理。通过对自扩散系数的结果分析,NO2气体在IRMOF系列材料、具有开放金属位点的MOFs材料和ZIF系列材料中的自扩散系数随着气体浓度增加先升高后降低;然而在MIL系列材料中自扩散系数仅随着气体浓度增加而降低。同时研究表明在IRMOF-9、MgMOF-74、ZiF-3、MIL-47和MIL-53Crht等材料中NO2气体均具有较好扩散性能。其主要受材料PLD和VF影响,在同系列材料中PLD和VF越大NO2气体的自扩散系数越大。因此对MOFs材料几何结构的合理设计,决定NO2气体自扩散性能。

研究扩散机理发现,MOFs材料金属簇吸附性能的强弱影响NO2气体随浓度变化的自扩散系数曲线。当有强金属簇吸附位点的时候,NO2气体自扩散性能先受到协同促进效应影响,后受到空间位阻效应影响;当无强金属簇吸附位点的时候,主要受空间位阻效应影响。

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